Las colecciones quedan reflejadas en la signatura asignada a cada libro. La signatura es un código que indica dónde está colocada una obra. Por ejemplo, MSS FLL 35. Las primeras letras indican la colección (en este caso Manuscritos del fondo de Filología) y los números currens de colocación en el Depósito. Los fondos y signaturas disponibles en esta biblioteca son los siguientes: