Son programas que permiten al usuario crear su propia base de datos personal, importando las referencias bibliográficas de distintas fuentes como bases de datos o catálogos de bibliotecas, así como insertar las citas en el texto de manera automática y crear bibliografías.
Las referencias guardadas se pueden utilizar como bibliografía, dándoles el formato bibliográfico adecuado (ya sean las normas de Vancouver o las determinadas por la revista dónde se publique) de manera automática.
Los principales gestores bibliográficos son: